Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms