Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms