Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms