Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNC2Q96PR1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNC2Q96PR1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms