Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms