Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAPZA3Q96KX2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAPZA3Q96KX2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAPZA3Q96KX2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CAPZA3Q96KX2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAPZA3Q96KX2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAPZA3Q96KX2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAPZA3Q96KX2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAPZA3Q96KX2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms