Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms