Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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USP9XQ93008 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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USP9XQ93008 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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USP9XQ93008 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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