Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM9SF4Q92544 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms