Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCSTNQ92542 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms