Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms