Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC103Q8IW40 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC103Q8IW40 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms