Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms