Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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USP43Q70EL4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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USP43Q70EL4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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USP43Q70EL4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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USP43Q70EL4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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USP43Q70EL4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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USP43Q70EL4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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USP43Q70EL4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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USP43Q70EL4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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USP43Q70EL4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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