Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms