Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms