Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LACTB2Q53H82 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms