Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms