Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHKAPQ2M3C7 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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