Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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