Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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