Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms