Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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