Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SGCBQ16585 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SGCBQ16585 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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