Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK4Q16099 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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