Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYCP1Q15431 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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