Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD3Q15054 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms