Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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