Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms