Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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ITGA9Q13797 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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ITGA9Q13797 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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ITGA9Q13797 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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ITGA9Q13797 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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ITGA9Q13797 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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ITGA9Q13797 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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ITGA9Q13797 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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