Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms