Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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BFSP2Q13515 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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BFSP2Q13515 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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BFSP2Q13515 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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