Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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