Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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