Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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CSTF3Q12996 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CSTF3Q12996 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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