Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 359.8 ms