Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms