Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms