Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms