Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAT1AQ00266 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAT1AQ00266 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAT1AQ00266 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAT1AQ00266 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAT1AQ00266 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAT1AQ00266 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAT1AQ00266 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAT1AQ00266 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAT1AQ00266 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms