Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2P78314 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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