Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HBBP68871 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HBBP68871 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms