Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms