Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SPCS3P61009 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPCS3P61009 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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