Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTBP60709 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ACTBP60709 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTBP60709 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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