Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms