Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms