Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEMP55040 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEMP55040 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEMP55040 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms