Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB28P51157 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB28P51157 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB28P51157 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms