Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TTPAP49638 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms